En fonction de son projet personnel et professionnel, chaque étudiant.e compose son propre bouquet de cours et séminaires.

L’obtention du label, délivré par l’Université Toulouse Jean Jaurès, Arpège, le LabEx SMS et l'Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées est conditionnée à la validation de 6 UE sur 2 ans. A titre dérogatoire, 3 UE sur l’année de Master 2 permettent d'obtenir une attestation de parcours. Ces UE peuvent être réparties entre les semestres comme l’étudiant.e le souhaite.

Les modalités d’évaluation des cours sont définies par l’enseignant.e responsable du cours, en concertation avec l’équipe pédagogique d’Arpège. Les étudiant.e.s inscrit.e.s au séminaire doctoral "Les outils du genre" et au séminaire interdisciplinaire d’Arpège doivent également tenir à jour une feuille de présence.

Des regroupements de promotion sont organisés au cours de la formation. Chaque rentrée, une grande conférence inaugurale est proposée aux étudiant.e.s: Sirma Bilge le 21 octobre 2016, Christine Delphy le 29 septembre 2017.